2008年11月11日，科研诚信建设工作专家咨询委员会在北京召开了第二次会议。会议听取了科技部科研诚信建设办公室主任梅永红关于诚信办自2007年6月第一次专家咨询委员会会议以来开展的主要工作的报告；就诚信办组织起草或编写的《关于加强科研诚信建设的意见》（征求意见稿）、《科研活动诚信指南》（暂定名，征求意见稿）、《科研诚信知识读本》（征求意见稿）等材料进行了审议；听取了关于在六个国家科技计划项目承担单位进行科研诚信状况典型调查情况的汇报，并就今后如何进一步推动我国的科研诚信建设工作提出了意见和建议。
专家们在发言中，就我国科研诚信建设的形势、影响科研诚信的多方面因素、制定符合我国实际的科研诚信指南、加强科研诚信建设的策略与步骤，以及如何通过政府部门之间和各有关方面的协同工作，使科研诚信的制度和措施得到落实等问题展开了深入的讨论，并对提交会议讨论的材料提出了具体的修改意见。
科技部部长万钢到会听取了专家们的意见并讲话。他表示，科技部明年将会同有关方面从促进自主创新、加强科研诚信建设的角度，对科技、教育、人才、科研经费管理等方面的相关制度进行调研。同时，科技部在科技计划管理方面，将把预防科研不端行为的关口前移，从制定完善科研行为规范、改进科技计划项目管理制度与措施、严肃查处科研不端行为和加强宣传教育等方面，促进科研诚信建设体系的不断完善。
专家咨询委员会主任徐冠华同志主持了会议，咨询委员会委员周光召、张存浩、李振声、王大中、孙家栋、王天然、段瑞春、吴锋、金吾伦、丁抗、张弥曼、关桥出席了会议。科技部党组书记、副部长李学勇在会议期间也与专家们进行了交流。
