中科院与北京市全面合作协议书的主要内容包括：鼓励和支持中科院研究机构与北京企业共建研发中心、技术中心、产业孵化平台等机构，搭建公共条件支撑平台，促进技术中介机构发展，共建并完善科技成果转化的服务机构；发挥中科院的技术、人才优势，共同推动人才管理、人才培养和人才交流的创新机制。双方合作研发一批资源节约和生态治理修复技术，能够提升城市信息化管理水平的应用技术，解决首都城市管理和城乡协调发展面临的瓶颈问题。 

　　北京市的超大规模集成电路、新一代宽带无线移动通信、重大新药研发等产业的基础在国内具有领先地位。对于这些重大领域双方共同开展国家重大科技项目的“落地”实施工作。